1.食品工業中的應用
營養成份分析：氨基酸、碳水化合物、維生素等
食品添加劑：防腐劑、香料、保鮮劑等
有害成分：獸藥殘留、農藥殘留等
無機成份：霉素（）
2.在制藥工業中的應用
藥物鑒別；雜質檢測（原料、中間體、副產物等）； 含量測定；手性分離；藥物代謝動力學研究、臨床血藥濃度等檢測中應用非常廣泛
3.在精細化工分析中的應用
醇、醛和酮、醚的分離分析；酸和酯的分離分析；表面活性劑的分析；聚合物的分析研究
4.在生物工程和生物化學中的應用
氨基酸、多肽和蛋白質的分析研究；核堿、核苷、核苷酸和核酸的分析研究；生物胺的分析研究；主要應用于基因突變分析中，能夠滿足大規模的基因變異檢測篩查。
5.在環境監測中的應用
多環芳烴的檢測（有機燃料未燃燒產生）；多氯聯苯（PCB）的檢測；農藥殘留的檢測（有機磷、氯、除草劑等）；酚類和胺類的檢測（化工、燃料、制藥等產生的工業廢水）