【儀器網 時事聚焦】生物的遺傳信息隱藏在每一個細胞中,我們剪掉的指甲、脫落的毛發和皮屑、流出的汗水和唾液,這些人體上毫不起眼的東西都包含著我們的基因,只要我們還存在生理活動,就在源源不斷地向環境中釋放我們的身體信息。有時候,只需要一塊咬過的口香糖,科學家就可以通過先進的儀器檢測出我們全部的基因組,并以此還原我們的外表。這并不是什么天方夜譚,前幾日,科學家就在一塊距今約5700年前的“口香糖”上實現了它。
17日,一項關于古人類的遺傳學研究在英國《自然·通訊》雜志發表。來自丹麥哥本哈根大學的考古研究團隊得到了一塊樺樹瀝青樣本,并對其進行了DNA提取和分析。樺樹瀝青是一種由樺樹皮加熱后產生的具有黏性的物質,一般被用作膠黏劑。但在考古發掘中發現的小塊樺樹瀝青經常出現牙印,這意味著史前人類可能曾像嚼口香糖一樣咀嚼樺樹瀝青。
研究團隊在樣本上提取出了一名女性的全部基因組,并為這名女性取名為“Lola”。根據DNA測序時發現的遺傳變異情況,研究人員推測出了“Lola”可能的外貌——黝黑皮膚、深色頭發以及藍色眼睛。此外,研究人員還對樣本中的其他非人類DNA進行了檢測分析,發現了疑似生活在“Lola”口腔中的微生物,例如牙齦卟啉單胞菌,以及一些動植物殘留。這為研究者提供了“Lola”的飲食習慣以及口腔的微生物信息,對于古人類研究具有重要的意義。
古DNA研究是分子考古學的核心,也是古生物研究的重要方式。與現代的DNA研究類似,古DNA研究同樣需要取樣、提取、擴增和測序等步驟,主要通過試劑盒或者全自動核酸提取儀從化石中分離提取DNA,然后利用PCR儀對提取的古生物DNA進行PCR反應及分子克隆,擴增后獲得一系列DNA片段,再合成完整的DNA序列。
然而古DNA的提取和合成并不是一件簡單的事。首先自然條件下古生物化石保留的遺傳信息有限,DNA的保存受到環境很大的制約,高溫、潮濕、微生物等因素都可能造成DNA的破壞。其次,化石中的DNA還可能受到其他生物的污染,在測序時很難找到目標DNA。另外外,在測序時,PCR反應需要消耗提取出的DNA,會耗費大量的樣品、試劑以及時間。技術成為除研究材料之外影響古DNA研究的主要因素。
目前,古DNA研究技術已經有了不少突破,如利用宏基因組學和高通量直接測的方法,不需要擴增就可以從提取物中獲得古DNA序列;利用人工合成的RNA“探針”對樣本進行“凈化”,篩選出古人類DNA等等。技術的進步讓人們更容易從化石中獲得生物的遺傳信息,也讓人們在人類起源、遷移、演化以及動植物的馴養等方面取得更多的成果。
不僅如此,古DNA測序的進步也會影響到現代DNA檢測技術的發展,基因研究的相關儀器將因此受益。
資料來源:科技日報
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