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針對不同的應用以及不同的污染，消解罐有不同的清洗方法。
1.常規清洗方法
此方法適用于大部分消解后的罐子清洗，步驟如下：
1）用熱的清洗液清洗消解罐：用海綿或者脫脂棉擦洗消解罐內的可見污物，應避免使用硬質毛刷清洗消解罐，以避免劃傷消解罐，從而造成更容易吸附樣品以及降低罐子使用壽命。
2）依次用自來水和去離子水沖洗消解罐，干燥后放置在一個干凈且干燥的地方備用。
3）蓋子部分不必每次消解完樣品都清洗，一天只需清洗一次，清洗步驟按照清洗液---自來水---去離子水---干燥的步驟清洗即可。
4）外套禁止用任何試劑清洗，如有污物或者酸滴用濕布擦拭干凈。
5）如果污物中有某些清洗液很難清洗干凈的有機物，則可能需要用到丙酮，二甲苯之類的溶劑，使用此類溶劑清洗消解罐時注意殘留溶劑一定要用水沖干凈。
6）不同污物所需清洗溶劑：
| 污物種類 | 清洗試劑 |
| 灰塵，大部分鹽類，部分氧化物等物質 | 熱清洗液 |
| 金屬及金屬氧化物等物質 | 酸（硝酸，鹽酸，氫氟酸等） |
| 脂肪，油類（焦油，油脂，石油等），樹脂等物質 | 有機溶劑（如丙酮，二甲苯等） |
7）痕量分析之前除上述清洗步驟外消解罐還需要在10%的硝酸酸缸里浸泡至少24小時。
2.特殊污染物的清洗方式
此類污染物使用常規清洗方法很難清洗干凈，此時根據污染物的種類需用
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